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Os transgênicos, vêm sendo motivo de polêmica.Na mídia, os debates apresentados geralmente são de interesse político e econômico, onde as discussões giram em torno dos lucros e prejuízos, que a técnica representa para industrias como as de agrotóxicos, de remédios que seriam prejudicadas no caso de organismos transgênicos resistentes a doenças e pragas. Há também debates, sobre a extinção de espécies e  produtos ecológicos que a transgênese poderia representar, sobre o  monopólio das sementes transgênicas pelas industrias que detém a patente.

Mas, a maioria dos opinantes não sabe o que é um organismo transgênico. Para entendermos o que é uma organismo transgênico, primeiro, temos que entender a composição de uma célula.

Todos os organismos vivos, sejam plantas ou animais, são formados por células e, no interior de cada célula, encontra-se o genoma, constituído de uma fita dupla de DNA que guarda o código de todas as características do organismo como: cor, tamanho, resistência a doenças, temperamento físico, se for célula animal, enfim, toda conformação do ser vivo.

Um organismo geneticamente modificado de forma artificial, com a intervenção do homem, é um organismo transgênico, pois neste organismo foi implantado no genoma de sua célula,  um segmento de DNA da célula de outro organismo, sendo que, este organismo doador da característica incubada no seu DNA, pode ser de espécie diferente do organismo receptor do segmento de DNA . Um exemplo é o da batata transgênica Bt, onde foi implantado no genoma da célula da batata, um segmento de DNA da bactéria Bacillus thuringienis, responsável pela produção de uma toxina que mata insetos, pela obstrução de seus intestinos e, portanto, este DNA da bactéria implantado na célula da batata, passará a produzir esta toxina Bt na planta, que ficará impregnada de toxina Bt nas folhas, caule, frutos (batatas) e quando um predador (inseto, lagarta) ingerir a planta com a toxina Bt, morrerá, pela destruição de seus intestinos.

Segundo os biotecnólogos, a toxina Bt é inofensiva para seres humanos, cujos intestinos não reconhecem o Bt. Portanto, um organismo transgênico passa a expressar uma nova característica, provinda de outro organismo de espécie diferente, ou, o pé de  batata passou a produzir uma substância fatal aos seus predadores, substância esta buscada numa bactéria.

Do ponto de vista genético, não se pode afirmar ainda, que nenhum organismo transgênico venha a  provocar, no futuro, riscos á saúde ou á natureza, pois ainda não há pesquisa suficiente para saber se a nova característica que o organismo vai expressar, poderá provocar efeitos indesejáveis ao nosso organismo. No caso da batata Bt não haveria problemas em ingeri-las já que a toxina Bt não produz efeito em nosso organismo, já na soja transgênica, seu efeito ainda é desconhecido e portanto, não sabemos quais riscos estamos expostos a adquirir ao consumir soja transgênica.

 Isso não significa, que os transgênicos representem uma ameaça, tudo é questão de tempo, para análise de resultados de estudos e testes que vêm sendo realizados e, se os resultados forem positivos, a transgênese será mais uma técnica, que visa  outro grande passo no avanço tecnológico da medicina, agricultura e a indústria.